為滿足藥品生產線對用水的高標準要求，制藥純化水設備的工藝性能固然高效。但由于受到環境、設備及工 藝等影響，水極易滋生微生物并助其生長，因此微生物指標是其重要的質量標準，在制藥純化水設備系統設計、安裝、驗證、運行和維護中需采取各種措施抑制其生長。小編認為：合理科學的設計可以更好的防止微生物的污染，從水系統的設計原則出發，從源頭控制污染才是解決問題的關鍵。
 

　　首先采取預處理階段降低可生化性有機物及殺菌的方式。常規的殺菌方法包括加氯或次氯酸鹽、臭氧、紫外線殺菌器等。也可利用DBNPA或異噻磋啉酮等非氧化性殺菌劑對純凈水設備進行沖擊式殺菌。當設備發生微生物污染后，要及時進行殺菌以及化學清洗，防止微生物大量繁殖。為防止微生物產生抗藥性，要不定期改變殺菌劑種類以及殺菌方式。
 

　　避免出現死角
 

　　好的工程規范是在有可能的情況下盡量減少或去除死角。常見的做法是限制死角小于 6倍分支管徑或更小,這是源于 1976 年CFR212 規范中所提出的“6D”規定。最近，行業方面的專家建議指導采用 3D或更小，而 WHO所建議的死角長度是 1。5D或更小。然而，這個新的指導引起了混亂，因為這個標準的建議者通常是從管道外壁來討論死角的長度，但是最初的 6D法規指的是從管道中心到死角末端的距離。顯而易見,如果一個 1/2 英寸的分支放在一個 3英寸的主管道上，從主管道中心到管道的外壁已經是 3D了。因此，即使是零死角閥門可能都達不到 3D 要求。
 

　　在設計時就要特別注意微生物生長的問題，通過系統工藝設計來盡量避免微生物的生長，以此來保證產水的達標，滿足藥品生產線對生產用水的高標準需求。